Il seminario è stato aperto a Gerusalemme nel Dicembre 1852 dal Patriarca Valerga. E' stato trasferito a Beit Jala il 7 Settembre 1857 a causa della situazione ed è tornato a Gerusalemme parecchie volte, mentre la sua base principale è sempre stata Beit Jala, stabilito per sempre a Beit Jala dal 7 Luglio 1936.

I formatori sono stati all'inizio i sacerdoti del Patriarcato Latino di Gerusalemme. Nell'Ottobre 1921 la formazione è stata affidata ai monaci benedettini dell'Abate della Dormizione di Gerusalemme e nell'Ottobre 1932 ai sacerdoti del Sacro Cuore di Gesù di Betharram. Da Luglio 1980, la responsabilità è tornata di nuovo ai sacerdoti del Patriarcato Latino di Gerusalemme. Le suore di San Carlo Borromeo hanno servito il seminario dal 1921 fino al 1929, dopodiché sono state sostituite dalle suore di Santa Dorotea di Vicenza.

Il corso di studi comprende un anno propedeutico di spiritualità, un anno di lingua francese per imparare bene la lingua, due anni di filosofia seguiti da quattro anni di teologia, un anno di esperienza pastorale nelle parrocchie prima dell'ordinazione diaconale. Il corso di studi di teologia è stato affiliato all'Università Pontificia Lateranense a Roma il 3 maggio 1967, e il curriculum di filosofia il 30 Aprile 1976. Queste affiliazioni danno la possibilità agli studenti di ricevere, alla fine di ciascun programma, un grado di istruzione che è il baccalaureato in filosofia ed il baccalaureato in teologia.

Il programma accademico e il programma di formazione sono basati sul Ratio Fundamentalis, l'Esortazione Apostolica Pastores Dabo Vobis, l'Ordo della Pontificia Università Lateranense e il Ratio Studiorum del seminario che è stato ristabilito nell'anno 1990 e pubblicato come ordine accademico generale. I corsi vengono svolti in Arabo, Francese, e occasionalmente in Inglese.

Fondato principalmente per il clero locale arabo, è stato tradizionalmente e rimane aperto per gli studenti delle altre istituzioni e paesi che desiderano prepararsi per il servizio della Chiesa di Terra Santa. Dall'inizio, nel 1852 fino all'anno accademico 2006 - 2007, sono stati formati e ordinati 267 sacerdoti, 11 di loro sono diventati vescovi, due di loro patriarchi.