رسالتنا في المعهد هي أن نعطي الطلاب – كهنة الغد – تربية ثقافية متينة، ومعها تربية إنسانية وروحية ورعوية تتناسب ووضع كنيسة القدس، "أم الكنائس". فهي كنيسة عددها قليل، تعيش جنبًا إلى جنب وسط أغلبية مسلمة أو يهودية.